1.商标注册查询有盲区。什么是盲区？盲区是指商标注册提交到商标局后，商标局收文后要经过商标局通达中心书审、查款、扫描后转到计算机中心录入到商标数据库，数据库更新后才可以查询到，也就是说在数据库更新前的这段时间便是查询盲区，这个盲区的时间长短并不固定，因为每天每月每年的商标报件量都不可能固定，目前的盲区期大概是3-4个月。 有盲区的存在，查询在理论上便不可能说100%准确，那么查询就不可能保证一定通过。
2.查询商标非审查。不考虑盲区，查询也不可能保证通过，这是因为查询是自己或代理人来查询，并非像工商名称登记那样进行预先审查，因此查询后仍然需要根据查询结果来分析比对，在分析中，当然会存在以下几种可能使得查询的判断与最终的审查出现不一致，如：
（1）查询出来的结果，明明有近似商标，但自己或代理人判断不准确造成注册失败，也就是说，查询出来后，结果的分析与判断与代理人对审查标准的掌握熟悉程度以及从业经验有着密切关系；
（2）查询后已经获知风险了，但仍然提交，最终导致注册失败；
（3）查询时未注意查询细节，如关联群组的查询，尤其是与自己想保护的产品相关联的类似情况没有查询到而导致注册失败。